在自動化流水線中，控制系統有著非常重要的作用，在流水線控制系統中，主要利用現場總線進行溝通和交流，現場總線還可以將控制點連接起來成為一個系統，從而對自動化生產線實行控制，在工業自動控制中，對于控制方案的選擇，在實現所需功能的前提下，就遵循“簡便、實用、穩定”的原則，一般有以下幾種方法：

  1、在有大量開關量，比如按鈕、開關、觸點的使用場合中，一般可以選用編程邏輯控制器為最佳，現在，編程邏輯控制器的輸入輸出點數眾多，完全可以滿足有大量開關量的控制系統中，以充分發揮其優勢。而在開關量數量較小(一般在10點以下)時，使用單片機或用繼電器控制即可。

  2、在控制系統體積要求較小或成本要求較低時單片機
應是優先選用的，這也是其他控制方式不可比擬的；在要求有顯示、記錄、傳輸、監測、組態等功能時，工控機是必須的。

  3、在經常要更新或擴充功能的情況時，一般應選用 ，編程邏輯控制器或工控機為最佳；在中型或中等批量設備控制中，編程邏輯控制器有成本低、占用空間小、操作簡單等優勢，在這種場合，應用最廣。
       4、從抗干擾和穩定性的角度講，一般最優先應用編程邏輯控制器。
5、在定型后需大量生產的產品，功能相對單一時，一般應采用單片機控制系統來實現，這樣成本最低，效益最好。

  6、從使用者的角度來說，如果對使用人員素質要求低，一般應采用編程邏輯控制器或單片機的方式來實現。二者均可通過按鈕（鍵）來進行操作。
       7、在要求開發周期短或使用維護簡單時，應優先采用編程邏輯控制器。
       通過以上對編程邏輯控制器、單片機、工控機在控制系統中應用的分析，可以看到三者在控制方面各有優勢，而工作是現場千變萬化，新的控制方式也會不斷出現，但仍然要遵循“簡便、實用、穩定”的原則，只有這樣才能使自動化生產流水線控制更加先進、高效。